Generating an article network using rentrez and igraph in R

One thing I often find myself trying to do is to read up on relevant literature within a new field. Often it’s difficult to identify seminal papers as a new-comer, so I’ve often wondered if there would be a way to quickly identify key papers. Over Christmas I read two really good articles on creating […]

Tools and tips for reproducible science from Rich FitzJohn

Rich FitzJohn, a computational biologist and director of puppets, made a very nice slideshow of how to produce reproducible science using a few tools revolving around R. It’s a great read! You can download the slideshow here, but the gist is in this slide I think (which I have stolen from the slideshow, hope it […]

Farveskeamer til videnskabelige figurer

Hvilke farver er bedst at bruge i videnskabelige figurer? Jeg kunne godt tænke mig at lave et skema, lidt a la det der ses her. Men har forfatterne til den tænkt over hvilke farver der er gode at bruge? Og er der nogle farver der er bedre at bruge, end andre? Efter lidt søgning på […]

Kombineret boxplot og beeswarm grafer i R

Her den anden dag ville jeg gerne lave en såkaldt boxplot graf for at fremstille lidt data. Her er hvad jeg endte med: Hvordan laver man nu det? Jeg har før leget med open-source programmet R. Det er gratis og indeholder temmelig omfattende statistiske og grafiske egenskaber. I dette eksempel tager jeg udgangspunkt i offentlig […]